- Biorobootika Keskus
- Sardtehisintellekti labor
- Proaktiivtehnoloogiate labor
- Lainetuse dünaamika uurimisrühm
- Meredünaamika modelleerimine ja kaugseire uurimisrühm
- Veeteede ohutuse uurimisrühm
- Konstruktsiooni ja vedelikumehaanika uurimisrühm
- Meretehnika uurimisrühm
- Meretehnoloogia ja hüdrodünaamika
- Merenduse küberjulgeoleku keskus
- Sinimajandus, veeressursid ja mereökoloogia uurimisrühm